Mmmmh, bonne question.
J'aurais tendance à dire qu'à l'horizontale, on risque des coulures effectivement. Mais si tu le fait sécher à la verticale avec le cache posé, pas de risque de poussières. Et puis le tube n'est pas parfaitement étanche, donc l'humidité a de la place pour s'évader. Par contre là, au lieu de coulures, on a des risques de petites taches d'évaporation. Mais c'est pas grave, elles n'altèrent en rien la puissance du miroir. Et si tu laves ce dernier tous les ans (comme préconisé en général), pas plus de souci que ça.
Pour les oculaires, perso, je laisse aussi le temps du dodo post observation pour sécher. Comme j'ai une mallette de rangement, ils sont couchés dans la mousse, sans les bouchons, et couvercle ouvert bien entendu. Mais, de toute façon, je nettoie tout à chaque fois. Petit coup de soufflette et de Lenspen sur les lentilles, je remets les bouchons et dépoussiérage du corps au pinceau en soies de martre.
Après, attention, je ne pense pas qu'il y ait UNE méthode.